Функціонування кожного вищого навчального закладу визначається професійною акредитацією, на основі якої цей заклад може видавати дипломи. Протягом останніх трьох місяців акредитацію, під час якої комісії оцінювали діяльність спеціальностей , проходив і Закарпатський угорський інститут ім. Ференца Ракоці ІІ.
Після позитивної оцінки комісії та фахівців, матеріали щодо спеціальності «початкова освіта» на рівні «магістратура» були передані Національному агентству із забезпечення якості освіти. Однак голова нацагенції Сергій Квіт не вніс документи на порядок денний, заявивши, що зробив це на прохання Служби безпеки України, котра має претензії до сертифікаційних процесів у виші та роботи там членів відповідних комісій, про що відомство написало у листі на ім’я Квіта. Очільник нацагенції не надав більше інформації, але очікується, що в інститут відправлять знову оцінювачів якості, їх прибуття планується 26-27 квітня.